通过分子动力学模拟，可以预测蛋白质子在不同外界环境下的三维结构，同时也能揭示蛋白质与小分子药物、酶抑制剂或毒素等配体之间的动态相互作用，以及RNA和DNA的折叠、剪接、复制和转录等过程，这对于药物设计和筛选具有重大意义。
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